1つのHTMLファイルに複数のFPEを組み込む場合、openFPE関数を複数定義する必要があります。

FPEを2つ組み込む為に定義ファイルを2つ用意し、それぞれ異なる画像を3枚づつ表示させる為の具体例を示します。

ファイル構成config1.xml(定義例)
Flash Presentation Engine 本体misfpe.swf(FPE本体)
HTMLファイル???.html(HTMLファイル)
ディレクトリconf
結合アイコン定義ファイルconfig1.xml
結合アイコン定義ファイルconfig2.xml
ディレクトリpic
結合アイコン画像ファイルA001.jpg
結合アイコン画像ファイルA002.jpg
結合アイコン画像ファイルA003.jpg
結合アイコン画像ファイルB001.jpg
結合アイコン画像ファイルB002.jpg
結合アイコン画像ファイルB003.jpg
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<pagedata>
<common>

    <copyright>elz.jp</copyright>

    <image_max>3</image_max>
    <effect_type>31</effect_type>
    <effect_time>10</effect_time>
    <stop_time>30</stop_time>

    <!-- プレフィックスでの画像位置指定 -->
    <prefix>pic/A</prefix>

</common>
</pagedata>
config2.xml(定義例)
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<pagedata>
<common>

    <copyright>elz.jp</copyright>

    <image_max>3</image_max>
    <effect_type>31</effect_type>
    <effect_time>10</effect_time>
    <stop_time>30</stop_time>

    <!-- プレフィックスでの画像位置指定 -->
    <prefix>pic/B</prefix>

</common>
</pagedata>
openFPE関数(JavaScript)での組み込み例
<SCRIPT language="JavaScript" type="text/javascript">
<!--
openFPE('misfpe.swf','???.jpg',???,???,'config/config1.xml','#ffffff');
//-->
</SCRIPT>
<NOSCRIPT>
<IMG SRC="???.jpg" WIDTH="???" HEIGHT="???" alt="փC[W">
</NOSCRIPT>

<SCRIPT language="JavaScript" type="text/javascript">
<!--
openFPE('misfpe.swf','???.jpg',???,???,'config/config2.xml','#ffffff');
//-->
</SCRIPT>
<NOSCRIPT>
<IMG SRC="???.jpg" WIDTH="???" HEIGHT="???" alt="փC[W">
</NOSCRIPT>

FPEを2つ組み込む為にopenFPE関数を2つ連続で定義しています。
openFPE関数で任意の定義ファイルを指定することで、それぞれ異なる画像を表示させることができます。